En caso de detectar durante la inspección alguna falta grave o que ponga en peligro algún recurso natural se impone alguna o algunas medidas de seguridad, como es el caso del aseguramiento de algún vehículo, maquinaria, embarcación, equipo, especies marinas o forestal, ejemplar, y producto o subproducto de flora o fauna silvestre. El dictamen de la Resolución Administrativa que se sigue puede considerar sanciones que deriven en el dec omiso del bien asegurado.

En el año 2001 se incremento considerablemente el decomiso debido al abatimiento del rezago en la resolución de procedimientos administrativos, en preparación para la transferencia de atribuciones en materia de inspección y vigilancia pesquera a la Sagarpa.